PPBDs-containing Proteins Classification:      (pS/pT)/PDZ

※ PDZ family introduction

    The PDZ domain is a common structural domain of 80-90 amino-acids found in the signaling proteins of bacteria, yeast, plants, viruses and animals. Proteins containing PDZ domains play a key role in anchoring receptor proteins in the membrane to cytoskeletal components. Proteins with these domains help hold together and organize signaling complexes at cellular membranes. These domains play a key role in the formation and function of signal transduction complexes. The PDZ domain of RGS3 were found to bind to the Tyr304 phosphopeptide of ephrin B2 in recent study (1).

Reference
1. Su, Z. (2011) Single phosphorylation of Tyr304 in the cytoplasmic tail of ephrin B2 confers high-affinity and bifunctional binding to both the SH2 domain of Grb4 and the PDZ domain of the PDZ-RGS3 protein. Eur J Biochem, 271, 1725-36. PMID: 15096211


p(S/T) PDZ in eukaryotes:

  Aegilops tauschii (1)  Ailuropoda melanoleuca (107)  Anas platyrhynchos (98)
  Anolis carolinensis (111)  Arabidopsis lyrata (1)  Arabidopsis thaliana (1)
  Aspergillus fumigatus (1)  Astyanax mexicanus (165)  Bos taurus (110)
  Brassica oleracea (2)  Brassica rapa (2)  Caenorhabditis elegans (38)
  Callithrix jacchus (115)  Canis familiaris (115)  Carlito syrichta (98)
  Cavia porcellus (112)  Cercocebus atys (115)  Chlorocebus sabaeus (108)
  Choloepus hoffmanni (49)  Ciona intestinalis (38)  Ciona savignyi (31)
  Danio rerio (171)  Dasypus novemcinctus (100)  Dipodomys ordii (98)
  Drosophila melanogaster (50)  Echinops telfairi (75)  Equus caballus (105)
  Erinaceus europaeus (71)  Felis catus (109)  Ficedula albicollis (101)
  Fukomys damarensis (100)  Gadus morhua (139)  Gallus gallus (107)
  Gasterosteus aculeatus (147)  Glycine max (1)  Gorilla gorilla (119)
  Gossypium raimondii (2)  Helianthus annuus (3)  Homo sapiens (121)
  Hordeum vulgare (1)  Ictidomys tridecemlineatus (112)  Latimeria chalumnae (107)
  Lepisosteus oculatus (121)  Loxodonta africana (103)  Lupinus angustifolius (1)
  Macaca fascicularis (118)  Macaca mulatta (113)  Manihot esculenta (3)
  Medicago truncatula (1)  Meleagris gallopavo (93)  Mesocricetus auratus (116)
  Microcebus murinus (113)  Monodelphis domestica (116)  Mustela putorius furo (114)
  Mus musculus (120)  Myotis lucifugus (104)  Nomascus leucogenys (112)
  Ochotona princeps (79)  Octodon degus (118)  Oreochromis niloticus (168)
  Ornithorhynchus anatinus (98)  Oryctolagus cuniculus (99)  Oryza brachyantha (1)
  Oryza indica (3)  Oryzias latipes (139)  Otolemur garnettii (111)
  Ovis aries (107)  Pan paniscus (113)  Pan troglodytes (123)
  Papio anubis (117)  Pelodiscus sinensis (101)  Petromyzon marinus (46)
  Phaseolus vulgaris (1)  Poecilia formosa (168)  Pongo abelii (111)
  Populus trichocarpa (3)  Procavia capensis (75)  Prunus persica (1)
  Pteropus vampyrus (92)  Rattus norvegicus (111)  Sarcophilus harrisii (95)
  Solanum lycopersicum (2)  Solanum tuberosum (1)  Sorex araneus (62)
  Sus scrofa (115)  Taeniopygia guttata (107)  Takifugu rubripes (157)
  Tetraodon nigroviridis (157)  Triticum aestivum (3)  Tupaia belangeri (68)
  Tursiops truncatus (107)  Vicugna pacos (55)  Xenopus tropicalis (111)
  Xiphophorus maculatus (157)  Yarrowia lipolytica (1)  Zea mays (1)