PPBDs-containing Proteins Classification:      (pS/pT)/FF

※ FF family introduction

    FF domains were first identified in the murine splicing factor FBP11 (formin-binding protein 11) as a repeated sequence of about 60 amino acids containing two conserved phenylalanine (F) residues that give name to the domain. FF domains are primarily present in only the following three proteins: Prp40, FBP11, and CA150. Most interestingly, Prp40, FBP11, and CA150 have all been shown to recognize phospho-CTD-RNAPII repeats through their FF domains (1).

Reference
1. Gasch, A. (2006) The structure of Prp40 FF1 domain and its interaction with the crn-TPR1 motif of Clf1 gives a new insight into the binding mode of FF domains . J Biol Chem, 281, 356-64. PMID: 16253993


p(S/T) FF in eukaryotes:

  Aegilops tauschii (2)  Ailuropoda melanoleuca (4)  Amborella trichopoda (1)
  Anas platyrhynchos (3)  Anolis carolinensis (3)  Arabidopsis lyrata (3)
  Arabidopsis thaliana (3)  Ashbya gossypii (1)  Aspergillus clavatus (1)
  Aspergillus flavus (1)  Aspergillus fumigatus (1)  Aspergillus nidulans (1)
  Aspergillus oryzae (1)  Aspergillus terreus (1)  Astyanax mexicanus (2)
  Beauveria bassiana (1)  Blumeria graminis (1)  Bos taurus (3)
  Brachypodium distachyon (3)  Brassica oleracea (3)  Brassica rapa (3)
  Caenorhabditis elegans (3)  Callithrix jacchus (4)  Canis familiaris (3)
  Carlito syrichta (4)  Cavia porcellus (4)  Cercocebus atys (4)
  Chlamydomonas reinhardtii (1)  Chlorocebus sabaeus (4)  Choloepus hoffmanni (3)
  Ciona intestinalis (2)  Ciona savignyi (1)  Colletotrichum higginsianum (1)
  Colletotrichum orbiculare (1)  Cryptococcus neoformans (3)  Cucumis sativus (3)
  Danio rerio (3)  Dasypus novemcinctus (4)  Dioscorea rotundata (2)
  Dipodomys ordii (4)  Dothistroma septosporum (1)  Drosophila melanogaster (2)
  Echinops telfairi (3)  Equus caballus (4)  Erinaceus europaeus (2)
  Felis catus (3)  Ficedula albicollis (3)  Fukomys damarensis (4)
  Fusarium oxysporum (1)  Fusarium pseudograminearum (1)  Gadus morhua (2)
  Gaeumannomyces graminis (1)  Gallus gallus (3)  Gasterosteus aculeatus (2)
  Glycine max (7)  Gorilla gorilla (4)  Gossypium raimondii (3)
  Helianthus annuus (4)  Homo sapiens (4)  Hordeum vulgare (1)
  Ictidomys tridecemlineatus (4)  Latimeria chalumnae (3)  Leersia perrieri (2)
  Lepisosteus oculatus (3)  Leptosphaeria maculans (1)  Loxodonta africana (4)
  Lupinus angustifolius (1)  Macaca fascicularis (4)  Macaca mulatta (4)
  Magnaporthe oryzae (1)  Magnaporthe poae (1)  Manihot esculenta (3)
  Medicago truncatula (3)  Melampsora laricipopulina (1)  Meleagris gallopavo (3)
  Mesocricetus auratus (4)  Microbotryum violaceum (2)  Microcebus murinus (3)
  Monodelphis domestica (3)  Musa acuminata (3)  Mustela putorius furo (4)
  Mus musculus (4)  Myotis lucifugus (4)  Neosartorya fischeri (1)
  Neurospora crassa (1)  Nicotiana attenuata (3)  Nomascus leucogenys (4)
  Ochotona princeps (3)  Octodon degus (4)  Oreochromis niloticus (3)
  Ornithorhynchus anatinus (5)  Oryctolagus cuniculus (3)  Oryza barthii (2)
  Oryza brachyantha (2)  Oryza glaberrima (1)  Oryza glumaepatula (2)
  Oryza indica (2)  Oryza longistaminata (2)  Oryza nivara (2)
  Oryza punctata (2)  Oryza rufipogon (2)  Oryza sativa (2)
  Oryzias latipes (2)  Ostreococcus lucimarinus (1)  Otolemur garnettii (3)
  Ovis aries (5)  Pan paniscus (4)  Pan troglodytes (4)
  Papio anubis (4)  Pelodiscus sinensis (4)  Petromyzon marinus (2)
  Phaeosphaeria nodorum (1)  Phaseolus vulgaris (3)  Physcomitrella patens (4)
  Poecilia formosa (2)  Pongo abelii (4)  Populus trichocarpa (4)
  Procavia capensis (4)  Prunus persica (3)  Pteropus vampyrus (3)
  Puccinia graminis (1)  Puccinia triticina (1)  Pyrenophora teres (1)
  Pyrenophora triticirepentis (1)  Rattus norvegicus (4)  Saccharomyces cerevisiae (1)
  Sarcophilus harrisii (2)  Schizosaccharomyces cryophilus (1)  Schizosaccharomyces japonicus (1)
  Schizosaccharomyces octosporus (1)  Schizosaccharomyces pombe (1)  Selaginella moellendorffii (4)
  Setaria italica (2)  Solanum lycopersicum (3)  Sorex araneus (3)
  Sorghum bicolor (2)  Sporisorium reilianum (2)  Sus scrofa (4)
  Taeniopygia guttata (3)  Takifugu rubripes (2)  Tetraodon nigroviridis (2)
  Theobroma cacao (3)  Trichoderma reesei (1)  Trichoderma virens (1)
  Triticum aestivum (6)  Triticum urartu (2)  Tuber melanosporum (1)
  Tupaia belangeri (4)  Tursiops truncatus (4)  Ustilago maydis (2)
  Verticillium dahliae (1)  Vicugna pacos (2)  Vitis vinifera (2)
  Xenopus tropicalis (4)  Xiphophorus maculatus (2)  Yarrowia lipolytica (1)
  Zea mays (3)  Zymoseptoria tritici (1)