PPBDs-containing Proteins Classification:      (pS/pT)/WD40

※ WD40 family introduction

    WD-40 repeats (also known as WD or beta-transducin repeats) are short ~40 amino acid motifs, often terminating in a Trp-Asp (W-D) dipeptide. WD40 repeats usually assume a 7-8 bladed beta-propeller fold, but proteins have been found with 4 to 16 repeated units, which also form a circularised beta-propeller structure. WD-repeat proteins are a large family found in all eukaryotes and are implicated in a variety of functions ranging from signal transduction and transcription regulation to cell cycle control and apoptosis. Repeated WD40 motifs act as a site for protein-protein interaction, and proteins containing WD40 repeats are known to serve as platforms for the assembly of protein complexes or mediators of transient interplay among other proteins. A widespread protein-interaction domain, of which some members (bTRCP and CDC4) bind specifically to pSer or pThr motifs. Many or most are probably not phospho-specific (1).

Reference
1. http://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/IPR001680


p(S/T) WD40 in eukaryotes:

  Aegilops tauschii (219)  Ailuropoda melanoleuca (248)  Amborella trichopoda (182)
  Anas platyrhynchos (211)  Anolis carolinensis (228)  Arabidopsis lyrata (239)
  Arabidopsis thaliana (227)  Ashbya gossypii (83)  Aspergillus clavatus (101)
  Aspergillus flavus (104)  Aspergillus fumigatus (109)  Aspergillus nidulans (108)
  Aspergillus niger (106)  Aspergillus oryzae (111)  Aspergillus terreus (106)
  Astyanax mexicanus (261)  Beauveria bassiana (111)  Blumeria graminis (91)
  Bos taurus (237)  Brachypodium distachyon (211)  Brassica oleracea (365)
  Brassica rapa (335)  Caenorhabditis elegans (115)  Callithrix jacchus (251)
  Canis familiaris (251)  Carlito syrichta (253)  Cavia porcellus (239)
  Cercocebus atys (265)  Chlamydomonas reinhardtii (152)  Chlorocebus sabaeus (238)
  Choloepus hoffmanni (150)  Ciona intestinalis (182)  Ciona savignyi (140)
  Colletotrichum higginsianum (107)  Colletotrichum orbiculare (94)  Cryptococcus neoformans (97)
  Cucumis sativus (179)  Cyanidioschyzon merolae (73)  Danio rerio (258)
  Dasypus novemcinctus (260)  Dioscorea rotundata (175)  Dipodomys ordii (223)
  Dothistroma septosporum (101)  Drosophila melanogaster (151)  Echinops telfairi (196)
  Equus caballus (242)  Erinaceus europaeus (185)  Felis catus (253)
  Ficedula albicollis (211)  Fukomys damarensis (236)  Fusarium oxysporum (112)
  Fusarium pseudograminearum (110)  Gadus morhua (258)  Gaeumannomyces graminis (121)
  Gallus gallus (227)  Gasterosteus aculeatus (262)  Glycine max (467)
  Gorilla gorilla (261)  Gossypium raimondii (310)  Helianthus annuus (334)
  Homo sapiens (261)  Hordeum vulgare (214)  Ictidomys tridecemlineatus (239)
  Komagataella pastoris (80)  Latimeria chalumnae (229)  Leersia perrieri (216)
  Lepisosteus oculatus (248)  Leptosphaeria maculans (98)  Loxodonta africana (244)
  Lupinus angustifolius (123)  Macaca fascicularis (268)  Macaca mulatta (264)
  Magnaporthe oryzae (99)  Magnaporthe poae (94)  Manihot esculenta (258)
  Medicago truncatula (254)  Melampsora laricipopulina (105)  Meleagris gallopavo (208)
  Mesocricetus auratus (240)  Microbotryum violaceum (99)  Microcebus murinus (253)
  Monodelphis domestica (256)  Musa acuminata (291)  Mustela putorius furo (249)
  Mus musculus (252)  Myotis lucifugus (253)  Neosartorya fischeri (110)
  Neurospora crassa (93)  Nicotiana attenuata (161)  Nomascus leucogenys (259)
  Ochotona princeps (201)  Octodon degus (257)  Oreochromis niloticus (266)
  Ornithorhynchus anatinus (219)  Oryctolagus cuniculus (234)  Oryza barthii (204)
  Oryza brachyantha (205)  Oryza glaberrima (191)  Oryza glumaepatula (208)
  Oryza indica (225)  Oryza longistaminata (193)  Oryza meridionalis (162)
  Oryza nivara (207)  Oryza punctata (218)  Oryza rufipogon (213)
  Oryza sativa (197)  Oryzias latipes (251)  Ostreococcus lucimarinus (108)
  Otolemur garnettii (252)  Ovis aries (254)  Pan paniscus (263)
  Pan troglodytes (273)  Papio anubis (270)  Pelodiscus sinensis (220)
  Petromyzon marinus (140)  Phaeosphaeria nodorum (98)  Phaseolus vulgaris (231)
  Physcomitrella patens (254)  Poecilia formosa (276)  Pongo abelii (244)
  Populus trichocarpa (309)  Procavia capensis (218)  Prunus persica (220)
  Pteropus vampyrus (233)  Puccinia graminis (106)  Puccinia triticina (94)
  Pyrenophora teres (104)  Pyrenophora triticirepentis (108)  Rattus norvegicus (248)
  Saccharomyces cerevisiae (89)  Sarcophilus harrisii (241)  Schizosaccharomyces cryophilus (107)
  Schizosaccharomyces japonicus (106)  Schizosaccharomyces octosporus (106)  Schizosaccharomyces pombe (105)
  Sclerotinia sclerotiorum (73)  Selaginella moellendorffii (347)  Setaria italica (225)
  Solanum lycopersicum (237)  Solanum tuberosum (190)  Sorex araneus (164)
  Sorghum bicolor (213)  Sporisorium reilianum (99)  Sus scrofa (243)
  Taeniopygia guttata (219)  Takifugu rubripes (258)  Tetraodon nigroviridis (260)
  Theobroma cacao (215)  Trichoderma reesei (115)  Trichoderma virens (145)
  Triticum aestivum (694)  Triticum urartu (196)  Tuber melanosporum (98)
  Tupaia belangeri (181)  Tursiops truncatus (236)  Ustilago maydis (100)
  Verticillium dahliae (95)  Vicugna pacos (153)  Vitis vinifera (235)
  Xenopus tropicalis (229)  Xiphophorus maculatus (262)  Yarrowia lipolytica (100)
  Zea mays (286)  Zymoseptoria tritici (94)