Protein Phosphatase Classification:      Asp-Based PSP/FCP

※ FCP family introduction

    FCP/SCP phosphatase belongs to a family of phosphatase which uses an Asp nucleophile for catalysis. FCP/SCP is characterized by its phosphatase activity towards the CTD of the largest subunit of RNA polymerase II (1). At least seven members have been identified in human genome and FCP/SCP phosphatases share a conserved catalytic signature, which is known as DXDXT/V (2). Family member FCP1 is conserved among all eukaryotes and plays an important role in cell survival in budding and fission yeasts. SCP1 preferentially dephosphorylates Ser5 in CTD domain of RNA polymerase II and plays a role in the regulation of gene expression by controlling the transition from initiation/capping to processive transcript elongation (3). In addition, SCP1 also acts as a key regulator that functions in silencing neuronal gene expression (4).

Reference
1. Shi, Y. (2009) Serine/threonine phosphatases: mechanism through structure. Cell, 139, 468-484. PMID: 19879837
2. Moorhead, G.B., Trinkle-Mulcahy, L. and Ulke-Lemee, A. (2007) Emerging roles of nuclear protein phosphatases. Nat Rev Mol Cell Biol, 8, 234-244. PMID: 17318227
3. Yeo, M., Lin, P.S., Dahmus, M.E. and Gill, G.N. (2003) A novel RNA polymerase II C-terminal domain phosphatase that preferentially dephosphorylates serine 5. J Biol Chem, 278, 26078-26085. PMID: 12721286
4. Yeo, M., Lee, S.K., Lee, B., Ruiz, E.C., Pfaff, S.L. and Gill, G.N. (2005) Small CTD phosphatases function in silencing neuronal gene expression. Science, 307, 596-600. PMID: 15681389


Asp-Based PSP FCP in eukaryotes:

  Aegilops tauschii (20)  Ailuropoda melanoleuca (8)  Amborella trichopoda (21)
  Anas platyrhynchos (5)  Anolis carolinensis (8)  Arabidopsis lyrata (29)
  Arabidopsis thaliana (23)  Ashbya gossypii (4)  Aspergillus clavatus (4)
  Aspergillus flavus (4)  Aspergillus fumigatus (4)  Aspergillus nidulans (4)
  Aspergillus niger (4)  Aspergillus oryzae (4)  Aspergillus terreus (4)
  Astyanax mexicanus (11)  Beauveria bassiana (4)  Blumeria graminis (4)
  Bos taurus (7)  Brachypodium distachyon (18)  Brassica oleracea (34)
  Brassica rapa (34)  Caenorhabditis elegans (5)  Callithrix jacchus (9)
  Canis familiaris (7)  Carlito syrichta (9)  Cavia porcellus (8)
  Cercocebus atys (10)  Chlamydomonas reinhardtii (11)  Chlorocebus sabaeus (7)
  Choloepus hoffmanni (5)  Ciona intestinalis (5)  Ciona savignyi (5)
  Colletotrichum higginsianum (4)  Colletotrichum orbiculare (5)  Cryptococcus neoformans (5)
  Cucumis sativus (14)  Cyanidioschyzon merolae (6)  Danio rerio (14)
  Dasypus novemcinctus (8)  Dioscorea rotundata (12)  Dipodomys ordii (8)
  Dothistroma septosporum (5)  Drosophila melanogaster (9)  Echinops telfairi (6)
  Equus caballus (8)  Erinaceus europaeus (8)  Felis catus (8)
  Ficedula albicollis (5)  Fukomys damarensis (9)  Fusarium oxysporum (4)
  Fusarium pseudograminearum (4)  Gadus morhua (12)  Gaeumannomyces graminis (5)
  Gallus gallus (6)  Gasterosteus aculeatus (13)  Glycine max (26)
  Gorilla gorilla (9)  Gossypium raimondii (27)  Helianthus annuus (27)
  Homo sapiens (9)  Hordeum vulgare (14)  Ictidomys tridecemlineatus (8)
  Komagataella pastoris (4)  Latimeria chalumnae (8)  Leersia perrieri (21)
  Lepisosteus oculatus (9)  Leptosphaeria maculans (4)  Loxodonta africana (8)
  Lupinus angustifolius (7)  Macaca fascicularis (10)  Macaca mulatta (9)
  Magnaporthe oryzae (4)  Magnaporthe poae (4)  Manihot esculenta (16)
  Medicago truncatula (29)  Melampsora laricipopulina (5)  Meleagris gallopavo (6)
  Mesocricetus auratus (9)  Microbotryum violaceum (5)  Microcebus murinus (7)
  Monodelphis domestica (9)  Musa acuminata (23)  Mustela putorius furo (8)
  Mus musculus (8)  Myotis lucifugus (7)  Neosartorya fischeri (4)
  Neurospora crassa (5)  Nicotiana attenuata (12)  Nomascus leucogenys (9)
  Ochotona princeps (8)  Octodon degus (12)  Oreochromis niloticus (12)
  Ornithorhynchus anatinus (6)  Oryctolagus cuniculus (9)  Oryza barthii (17)
  Oryza brachyantha (17)  Oryza glaberrima (17)  Oryza glumaepatula (17)
  Oryza indica (19)  Oryza longistaminata (17)  Oryza meridionalis (13)
  Oryza nivara (17)  Oryza punctata (17)  Oryza rufipogon (18)
  Oryza sativa (18)  Oryzias latipes (12)  Ostreococcus lucimarinus (10)
  Otolemur garnettii (8)  Ovis aries (8)  Pan paniscus (9)
  Pan troglodytes (10)  Papio anubis (10)  Pelodiscus sinensis (7)
  Petromyzon marinus (9)  Phaeosphaeria nodorum (4)  Phaseolus vulgaris (15)
  Physcomitrella patens (10)  Poecilia formosa (13)  Pongo abelii (8)
  Populus trichocarpa (24)  Procavia capensis (8)  Prunus persica (15)
  Pteropus vampyrus (8)  Puccinia graminis (10)  Puccinia triticina (6)
  Pyrenophora teres (4)  Pyrenophora triticirepentis (4)  Rattus norvegicus (8)
  Saccharomyces cerevisiae (5)  Sarcophilus harrisii (8)  Schizosaccharomyces cryophilus (5)
  Schizosaccharomyces japonicus (7)  Schizosaccharomyces octosporus (5)  Schizosaccharomyces pombe (5)
  Sclerotinia sclerotiorum (3)  Selaginella moellendorffii (77)  Setaria italica (17)
  Solanum lycopersicum (16)  Solanum tuberosum (10)  Sorex araneus (6)
  Sorghum bicolor (20)  Sporisorium reilianum (5)  Sus scrofa (8)
  Taeniopygia guttata (6)  Takifugu rubripes (12)  Tetraodon nigroviridis (12)
  Theobroma cacao (16)  Trichoderma reesei (4)  Trichoderma virens (5)
  Triticum aestivum (51)  Triticum urartu (19)  Tuber melanosporum (5)
  Tupaia belangeri (5)  Tursiops truncatus (8)  Ustilago maydis (5)
  Verticillium dahliae (4)  Vicugna pacos (4)  Vitis vinifera (16)
  Xenopus tropicalis (8)  Xiphophorus maculatus (13)  Yarrowia lipolytica (4)
  Zea mays (23)  Zymoseptoria tritici (3)