Protein Phosphatase Classification:      PPM/PDP

※ PDP family introduction

    Metal-dependent protein phosphatases (PPM) include protein phosphatases which dependent on manganese/magnesium ions (Mn2+/Mg2+). PPM group contains a high conserved catalytic domain instead of catalytic subunit and different regulatory domains determining the substrate recognition and function diversity. Pyruvate dehydrogenase phosphatase (PDP) also contain conserved PP2C catalytic domain. PDP mainly mediates the dephosphorylation of Pyruvate dehydrogenase (E1), one of the three components (E1, E2, and E3) of the large pyruvate dehydrogenase complex. Two isoforms of PDPc have been identified, PDP1 and PDP2. Both of them are magnesium dependent, although PDP2 requires a 10-fold higher Mg2+ concentration for its activity. PDP1 requires calcium and the interaction with E2. PDP1 is highly expressed in skeletal muscle and PDP2 reaches a high level in liver and adipocytes. Defects of PDP are involved in disease, such as lactic acidemia (1).

Reference
1. Maj, M.C., MacKay, N., Levandovskiy, V., Addis, J., Baumgartner, E.R., Baumgartner, M.R., Robinson, B.H. and Cameron, J.M. (2005) Pyruvate dehydrogenase phosphatase deficiency: identification of the first mutation in two brothers and restoration of activity by protein complementation. J Clin Endocrinol Metab, 90, 4101-4107. PMID: 18066953


PPM PDP in eukaryotes:

  Ailuropoda melanoleuca (2)  Anas platyrhynchos (2)  Anolis carolinensis (2)
  Ashbya gossypii (1)  Aspergillus clavatus (2)  Aspergillus flavus (2)
  Aspergillus fumigatus (1)  Aspergillus nidulans (1)  Aspergillus niger (1)
  Aspergillus oryzae (2)  Aspergillus terreus (2)  Astyanax mexicanus (2)
  Beauveria bassiana (2)  Blumeria graminis (1)  Bos taurus (2)
  Caenorhabditis elegans (1)  Callithrix jacchus (2)  Canis familiaris (2)
  Carlito syrichta (1)  Cavia porcellus (1)  Cercocebus atys (2)
  Chlorocebus sabaeus (2)  Choloepus hoffmanni (1)  Colletotrichum higginsianum (2)
  Colletotrichum orbiculare (1)  Cryptococcus neoformans (1)  Danio rerio (3)
  Dasypus novemcinctus (2)  Dipodomys ordii (2)  Dothistroma septosporum (1)
  Drosophila melanogaster (1)  Echinops telfairi (1)  Equus caballus (2)
  Felis catus (1)  Ficedula albicollis (2)  Fukomys damarensis (2)
  Fusarium oxysporum (2)  Fusarium pseudograminearum (1)  Gadus morhua (2)
  Gallus gallus (2)  Gasterosteus aculeatus (3)  Gorilla gorilla (2)
  Homo sapiens (2)  Ictidomys tridecemlineatus (2)  Komagataella pastoris (1)
  Latimeria chalumnae (2)  Lepisosteus oculatus (3)  Leptosphaeria maculans (1)
  Loxodonta africana (2)  Macaca fascicularis (2)  Macaca mulatta (2)
  Melampsora laricipopulina (1)  Meleagris gallopavo (2)  Mesocricetus auratus (2)
  Microcebus murinus (1)  Monodelphis domestica (2)  Mustela putorius furo (2)
  Mus musculus (2)  Myotis lucifugus (2)  Neosartorya fischeri (1)
  Nomascus leucogenys (1)  Ochotona princeps (2)  Octodon degus (2)
  Oreochromis niloticus (3)  Ornithorhynchus anatinus (2)  Oryctolagus cuniculus (2)
  Oryzias latipes (2)  Otolemur garnettii (2)  Ovis aries (2)
  Pan paniscus (2)  Pan troglodytes (2)  Papio anubis (2)
  Pelodiscus sinensis (2)  Petromyzon marinus (2)  Poecilia formosa (3)
  Pongo abelii (2)  Procavia capensis (1)  Pteropus vampyrus (2)
  Puccinia graminis (1)  Puccinia triticina (1)  Pyrenophora teres (1)
  Pyrenophora triticirepentis (2)  Rattus norvegicus (2)  Saccharomyces cerevisiae (1)
  Sarcophilus harrisii (2)  Schizosaccharomyces cryophilus (1)  Schizosaccharomyces japonicus (1)
  Schizosaccharomyces octosporus (1)  Schizosaccharomyces pombe (1)  Sorex araneus (1)
  Sporisorium reilianum (1)  Sus scrofa (2)  Taeniopygia guttata (2)
  Takifugu rubripes (2)  Tetraodon nigroviridis (2)  Trichoderma reesei (2)
  Trichoderma virens (3)  Tupaia belangeri (1)  Tursiops truncatus (2)
  Ustilago maydis (1)  Vicugna pacos (2)  Xenopus tropicalis (2)
  Xiphophorus maculatus (3)  Yarrowia lipolytica (1)